QRコード決済の手数料を一覧で比較！最安のサービスや導入方法を解説！

QRコード決済を導入したいけど、手数料の違いがわかりづらい…そんなお悩みを解消します。

この記事では主なQRコード決済サービスの手数料を一覧で比較し、コストを抑えて導入する方法までわかりやすく解説します。

QRコード決済とは？

QRコード決済とは、スマートフォンでQRコードを読み取るだけで支払いができるキャッシュレス決済サービスです。専用アプリを使って簡単に決済でき、現金のやり取りが不要になります。

QRコード決済の仕組み

QRコード決済には2つの支払い方式があります。

ユーザースキャン方式は、店舗に設置されたQRコードを顧客がスマートフォンで読み取る方法です。顧客自身が金額を入力して決済を完了させるため、店舗側は専用端末を用意する必要がありません。

ストアスキャン方式は、顧客がスマートフォンに表示したQRコードを店舗側が読み取る方法です。店舗側で金額管理ができるため、会計ミスを防げますが、QRコードを読み取るためのスマートフォンやタブレットが必要になります。

決済の流れとしては、顧客が事前にアプリに銀行口座やクレジットカードを登録し、店舗での支払い時にQRコードを介して決済が実行されます。売上金は各QRコード決済事業者を経由して、後日店舗の指定口座に振り込まれます。

QRコード決済の導入にかかる費用・手数料

初期費用の相場｜方式により異なる

QRコード決済の初期費用は、導入方式によって大きく異なります。

お客様が店舗のQRコードを読み取る「ユーザースキャン方式」は、初期費用がほとんどかからず、QRコードのステッカーやPOPも無料で提供されるのが一般的です。スマートフォンやタブレットなどの端末も不要なため、コストをかけずに導入できます。

一方、店舗側が顧客のQRコードを読み取る「ストアスキャン方式」では、専用端末やタブレット、スマホの購入が必要になる場合があり、初期費用は3万〜10万円程度が目安です。Wi-Fi環境の整備や導入サポート費用が別途かかることもあります。

月額費用の相場

多くのQRコード決済サービスでは、月額料金は無料で利用できるプランが基本です。とくにユーザースキャン方式であれば、完全無料で運用できるケースが大半です。

ただし、手数料を抑えたり機能を拡張したりする目的で、有料の月額プランが用意されているサービスもあります。たとえば、PayPayの「ライトプラン」では、月額1,980円（税込）でより低い決済手数料を適用するなど、コストと機能のバランスを選べる仕組みになっています。

決済手数料・振込手数料の相場

QRコード決済では、売上に応じた決済手数料が毎回発生します。相場はおおよそ1.6％〜3.25％前後で、サービスやプランによって異なります。低い手数料を適用するために月額プランの契約が必要な場合もあるため、事前に確認しておくと安心です。

また、売上金の振込時にかかる「振込手数料」にも注意が必要です。無料のサービスもありますが、1回あたり数百円の手数料が発生するケースもあります。入金サイクル（翌営業日・週1回・月1回など）とあわせて確認し、自社の資金繰りに合ったサービスを選ぶことが大切です。

QRコード決済サービスの決済手数料の比較一覧表

主要QRコード決済サービスの手数料を直接契約と決済代行サービス経由で比較すると、以下のようになります。

決済サービス	イメージ	初期費用	月額費用	決済手数料	入金サイクル	入金手数料
PayPay 無料プラン		無料	無料	1.98%	・月末締め翌日 　※PayPay銀行 ・月末締め翌々営業日 　※その他金融機関 ・早期振込サービス	月1回無料 早期振込サービス： 0.38%+ PayPay銀行：20円 その他金融機関：200円
PayPay マイストア ライトプラン		無料	1,980円	1.60%	・月末締め翌日 　※PayPay銀行 ・月末締め翌々営業日 　※その他金融機関 ・早期振込サービス	月1回無料 早期振込サービス： 0.38%+ PayPay銀行：20円 その他金融機関：200円
楽天ペイ		無料	無料	2.95%～ 新規加盟店は2.20%～	・毎日 （翌日入金） 　※楽天銀行 ・月1回 （末日締め翌月25日入金） 　※その他銀行	楽天銀行：無料 その他銀行：330円/回
d払い （メルペイ）		無料	無料	2.6% （メルペイとの 共通QRコードの場合）	・月1回 ・月2回 （1～15日分：当月25日入金 16～末日分：翌月10日入金）	無料（1万円以上） 1万円未満の場合：200円
au Pay		無料	無料	2.6%	・月1回 ・月2回 （1～15日分：翌月15日入金 16～末日分：翌月末入金） ・早期振込サービス	無料（1万円以上） 早期振込サービス： 210円

一番安い手数料はPayPayの直接契約で、1.60％（税別）から利用できます。ただし、この料率で利用するには「PayPayマイストア ライトプラン（月額1,980円・税別）」への加入が必要です。

決済代行サービス経由の場合、どのQRコード決済も手数料率に大きな差はなく、2.00％～3.24％の範囲内で設定されています。

また、手数料は税別表記のサービスが多いため、実際の負担額は表示料率よりも約10％高くなることに注意が必要です。

その他のQRコード決済サービス

主要サービス以外にも、FamiPayなどの特色あるサービスがあります。FamiPayの導入費用は無料です。決済手数料は、JPQR（QRコード決済の統一規格）を利用する場合は2.94%での利用が可能ですが、2023年12月で申込みが終了しました。

FamiPayの最大の特徴は、年間50億人以上の延べ人数が利用するファミリーマートの顧客を呼べる点にあります。ファミリーマートとの連携によるマーケティング効果を期待する事業者には有力な選択肢となります。

Alipay+やWeChat Payなどのインバウンド向けサービスも重要です。これらのサービスは中国からの観光客をターゲットとする店舗には欠かせない決済手段となっています。

QRコード決済の2つの導入方法

QRコード決済を導入する方法は、「各社との直接契約」と「決済代行サービス経由」の2つに大別されます。それぞれ手数料率や運用面で大きな違いがあります。

各社との直接契約

直接契約は、PayPayや楽天ペイなどの決済事業者と個別に契約を結ぶ方法です。

最大のメリットは手数料率の低さで、特にPayPayは1.60％～1.98％と業界最安水準で利用できます。また、各社が提供する独自の販促機能やキャンペーンを最大限活用できるのも利点です。

一方で、複数のサービスを導入する場合は、サービスごとに契約手続きが必要になります。レジ周りに複数のQRコードを設置することになり、売上管理や入金サイクルもサービスごとに異なるため、運用が煩雑になりがちです。

直接契約は、特定のQRコード決済サービスの利用率が高い店舗や、手数料を少しでも抑えたい店舗に適しています。特にPayPayの利用者が多い地域では、PayPayだけでも十分な集客効果が期待できます。

決済代行サービス経由

決済代行サービスは、複数のQRコード決済をまとめて利用できるサービスです。

決済代行サービスの最大のメリットは運用効率の向上です。一つの契約と決済端末で、QRコード決済だけでなくクレジットカードや電子マネーにも対応できます。売上管理や入金サイクルが一本化されるため、「どの決済がいつ入金されるか」を個別に確認する手間が省けます。

手数料は直接契約よりやや高めの2.00％～3.24％に設定されますが、レジ周りがすっきりし、お客様への案内もスムーズになります。また、様々な決済手段に幅広く対応できるため、顧客の利便性が大幅に向上します。

決済代行サービスは、多様な決済手段に対応したい店舗や、日々の運用効率を重視する店舗におすすめです。特に複数店舗を運営している場合は、管理の一元化によるメリットが大きくなります。

QRコード決済の導入方法を解説！費用・手数料を一覧で比較！おすすめサービスまで徹底解説

おすすめマルチ決済端末9選比較｜QRコード・クレジットカード・電子マネーを1台で

QRコード決済をはじめ、クレジットカードや電子マネーにもまとめて対応できるマルチ決済端末を導入すれば、レジ周りの負担を減らしながらキャッシュレス対応を一気に進めることができます。

サービス名

端末イメージ

おすすめ評価

初期費用

月額費用

決済手数料

入金手数料

入金サイクル

導入目安

契約条件

端末費用

周辺機器

電子マネー

QRコード

対応OS

屋外決済

stera pack

4.63 ★★★★★ ★★★★★

0円

初年度：0円 2年目以降：3,300円(税込) 直近1年間キャッシュレス売上 累計3,000万円以上で永年無料

クレカ：1.98%~ 電子マネー：3.24% QRコード：3.24%

三井住友銀行口座： 0円 その他金融機関： 220円(税込)

毎日締め（2営業日後払い） 月6回締め（2営業日後払い） 月2回締め（2 営業日後払い） 月2回締め（15日後払い）

最短約2週間

契約期間：3年間 違約金：無料※ ※ 解約申請から45日以内に 端末の返却が条件

0円 ※レンタル

レシートプリンター内蔵 電子サイン対応

交通系ICカード iD/楽天Edy nanaco/WAON QUICPay タッチ決済

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ/ゆうちょPay

iOS Android

✕

Square 決済

4.69 ★★★★★ ★★★★★

無料アカウント登録 0円

固定費全て0円

クレカ：2.5％ 電子マネー：3.25％ QRコード：3.25％

0円

最短翌日

最短翌日

契約期間：なし 違約金：無料

0円

POSレジアプリ タブレット不要 レシートプリンター内蔵 電子サイン対応 電子レシート発行

交通系ICカード Apple Pay iD QUICPay タッチ決済

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ Alipay+/WeChat Pay

iOS Android

〇

Square リーダー

4.60 ★★★★★ ★★★★★

0円

固定費全て0円

クレカ：2.5％ 電子マネー：3.25％ QRコード：3.25％

0円

最短翌日

最短翌日

契約期間：なし 違約金：無料

4,980円(税込)

スマホ・タブレット

交通系ICカード Apple Pay iD QUICPay タッチ決済

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ Alipay+/WeChat Pay

iOS Android

〇

Square Terminal

4.59 ★★★★★ ★★★★★

0円

固定費全て0円

クレカ：2.5％ 電子マネー：3.25％ QRコード：3.25％

0円

最短翌日

最短翌日

契約期間：なし 違約金：無料

39,980円(税込)

タブレット不要 レシートプリンター内蔵 電子サイン対応 電子レシート発行

交通系ICカード Apple Pay iD QUICPay タッチ決済

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ Alipay+/WeChat Pay

iOS Android

〇

STORES 決済

4.57 ★★★★★ ★★★★★

0円

プランによる 0円〜3,300円

クレカ：1.98%~ 電子マネー：1.98％~ QRコード：3.24％

0円

最短翌々日

最短3営業日

最低契約期間： スタンダード:1年 フリー:なし 違約金： 契約満了月分の月額費用

19,980円 ※スタンダードプランで0円

プリンター、ドロアーなど ネットショップで購入可

交通系ICカード iD QUICPay など

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ/ゆうちょPay Alipay+/WeChat Pay FamiPayなど

iOS Android

〇

スマレジ・PAYGATE POS

4.55 ★★★★★ ★★★★★

0円

3,300円(税込) ※その他プランあり

クレカ：1.98％~ ※割引キャンペーン 電子マネー：3.24％ ＱＲコード：2.00~

問合せ

・月2回 末締め翌15日払い 15日締め当月末払い

1~1.5か月

最低契約期間： 1年間 違約金： 契約満了月分の月額費用

39,600円 ※キャンペーンで0円

不要 レシートプリンター内蔵

交通系ICカード iD/楽天Edy WAON/nanaco QUICPay

PayPay 楽天ペイ d払い/au PAY メルペイ AliPay/WeChat Pay

Android

〇

JMS

4.53 ★★★★★ ★★★★★

0円

0円 ※無料

クレカ：2.48%~ 電子マネー：3.24％ QRコード：3.24％

0円〜198円

・月2回 無料 ・月6回 198円（税込）/振込毎

約4~6週間

最低契約期間：なし 違約金：無料

0円

タブレット不要

交通系ICカード Apple Pay/Google Pay iD/楽天Edy nanaco/WAON QUICPay タッチ決済

PayPay d払い 楽天ペイ Alipay+/WeChat Pay Smart code

iOS ※J-Mups II Pocket

〇

PayCAS Mobile

4.36 ★★★★★ ★★★★★

0円

4,000円~ →1,980円

クレカ：2.48%(非課税)~ 電子マネー：2.95%(税別)~ QRコード：2.8%(税別)~

0円

・月2回 15日締め当月末払い 当月末締め翌月15日払い

1カ月

最低契約期間：4年 違約金：問い合わせ

78,800円 ※特別セットプランで0円

不要 レシートプリンター内蔵 Android™ OS採用で 業務アプリ搭載可能

交通系ICカード Apple Pay/Google Pay iD Waon/nanaco QUICPay

PayPay d払い/au PAY 楽天ペイ メルペイ/J-Coin Pay AliPay/WeChat Pay ユニオン(銀聯)ペイ/JKOPAY

iOS Android

〇

Airペイ（エアペイ）

4.40 ★★★★★ ★★★★★

0円

0円 ※無料

クレカ：2.48％~ 電子マネー：3.24% QRコード：1.08％~

0円

・月6回 ・月3回

1週間~1ヶ月

最低契約期間：1年間 違約金：なし

20,167円 ※キャンペーンで0円

iPad：0円 カードリーダー：0円 ※条件を満たすと0円 レシートプリンター：別売 ※2万円～

交通系ICカード Apple Pay iD QUICPay タッチ決済

PayPay d払い/au PAY LINE Pay/J-Coin Pay Alipay/WeChat Pay ユニオン(銀聯)ペイ

iOS

△ 申請時に 書類必要

QRコード決済は他のキャッシュレス決済より手数料が高い？安い？

QRコード決済の手数料は、他のキャッシュレス決済と比較して低めに設定されています。

クレジットカード決済の手数料は一般的に3％～5％で、売上規模の小さい店舗ほど高い料率が適用されます。一方、QRコード決済は直接契約で1％台後半～2％台、決済代行サービス経由でも2％～3％台前半と、クレジットカードより低い水準です。

電子マネー決済の手数料は3％前後が相場で、QRコード決済とほぼ同等かやや高めです。ただし、電子マネーは専用リーダーの設置費用が必要になるため、初期費用を含めた総コストではQRコード決済の方が有利です。

例えば、1,000円の商品を販売した場合、クレジットカード決済なら30～50円、QRコード決済なら16～30円の手数料負担となり、QRコード決済の方が10～20円程度安くなります。

また、QRコード決済は現金管理コストの削減効果も期待できます。レジ締め作業の短縮、つり銭準備の軽減、売上金の管理・運搬費用の削減など、見えないコストの削減も含めると、総合的なメリットは手数料率以上に大きくなる可能性があります。

よくある質問（FAQ）

手数料無料のQRコード決済サービスはまだある？

現在、完全無料で利用できるQRコード決済サービスは存在しません。

QRコード決済サービスは、もともと「手数料無料」や「高額キャッシュバック」などのキャンペーンで急速に広まりました。しかし、2021年10月を境に、主要サービス各社は決済手数料を有料化しています。

当初はユーザーや加盟店の拡大を優先し、PayPayなどが「決済手数料0円」や「総額1億円還元キャンペーン」といった大規模施策を展開していました。ですが、ある程度の普及が進んだことから、各社は段階的に有料化に踏み切ったという背景があります。

一番安いQRコード決済の手数料はいくら？

一番安いのはPayPayの直接契約で、1.60％（税別）から利用できます。

ただし、この料率で利用するには「PayPayマイストア ライトプラン（月額1,980円・税別）」への加入が必要です。月額費用を考慮すると、月間決済額が12万円以下の店舗では、通常の1.98％料率の方が総コストは安くなります。

決済代行サービス経由の場合は、各社とも2.00％～3.24％の範囲で大きな差はありません。手数料率よりも、入金サイクルや対応決済手段、サポート体制を重視して選ぶことをおすすめします。

手数料の支払いタイミングと振込手数料は？

決済手数料は売上発生時に自動的に差し引かれ、振込手数料は入金時に発生します。

決済手数料は、QRコード決済が利用されるたびに売上金額から自動的に差し引かれます。例えば、1,000円の売上で手数料率2％の場合、手数料20円を差し引いた980円が売上金として計上されます。

振込手数料は、決済事業者から店舗口座への送金時に発生します。多くのサービスで、指定金融機関への振込や月1回の入金サイクルなら手数料無料になります。早期振込サービスを利用する場合は、別途0.3％～の手数料と振込手数料（200円程度）が必要です。

入金サイクルは、月1回から週1回まで事業者によって異なります。キャッシュフローを重視する場合は、入金頻度も考慮してサービスを選ぶことが重要です。

複数サービス導入時の管理方法は？

複数のQRコード決済を効率的に管理するには、決済代行サービスの利用がおすすめです。

各社と直接契約する場合、サービスごとに売上管理、入金確認、契約更新などの作業が発生します。5つのサービスを導入すると、月末には5回の売上集計と入金確認が必要になり、管理工数が大幅に増加します。

決済代行サービスなら、複数のQRコード決済の売上が一つの管理画面で確認でき、入金も一本化されます。手数料は直接契約より若干高くなりますが、管理コストの削減効果を考慮すると、総合的にはメリットが大きいケースが多いです。

特に複数店舗を運営している場合や、経理作業の効率化を重視する場合は、決済代行サービスの利用を強くおすすめします。

まとめ

QRコード決済の手数料は、サービスや契約方法によって1.60％～3.24％と幅があります。PayPayの直接契約が最安ですが、運用効率を考慮すると決済代行サービスの利用も有力な選択肢です。

2021年10月以降、完全無料のサービスは存在しないものの、クレジットカード決済と比較すると手数料率は低く設定されています。現金管理コストの削減効果も含めると、QRコード決済の導入メリットは手数料負担を上回る可能性が高いです。

政府は2025年までにキャッシュレス決済比率4割の目標を掲げており、2024年に42.8％と目標を達成した現在、将来的には80％を目指す方針を示しています。^※2

導入を検討する際は、手数料率だけでなく、入金サイクル、対応決済手段、サポート体制、管理のしやすさを総合的に評価することが重要です。特に複数の決済手段に対応したい場合は、決済代行サービスの利用により運用効率が大幅に向上します。

QRコード決済は今後も利用者の増加が見込まれており、早期導入により新たな顧客層の獲得や業務効率化のメリットを享受できるでしょう。

クレジット端末おすすめ18選の価格や手数料を比較！種類や選び方、導入の流れ

キャッシュレス決済端末おすすめランキング12選比較！無料で使える端末や選び方を解説

参考文献

※1「キャッシュレス決済実態調査2023（速報）」NIRA総合研究開発機構 https://www.nira.or.jp/paper/research-report/2023/212309.html

※2「2024年のキャッシュレス決済比率を算出しました」経済産業省 https://www.meti.go.jp/press/2024/03/20250331005/20250331005.html

※3「2021年度第2四半期決算説明会資料」Zホールディングス株式会社 https://www.lycorp.co.jp/ja/ir/library/presentations/main/01/teaserItems2/0/linkList/03/link/jp2021q2_presentation.pdf

※4「QRコード決済の利用率が66％と調査開始以降で最高」株式会社インフキュリオン https://infcurion.com/news/news-20230621_001/