決済代行会社15選をランキングで比較！手数料・料金一覧と選び方解説 

決済代行会社を選ぶ際は、単に「有名な会社」や「手数料が安い会社」を選ぶのではなく、自社の販売形態に合うかを基準に比較することが重要です。

本記事では、決済代行会社・決済サービスをランキング形式で手数料・初期費用・月額費用を比較し、対応決済、入金サイクル、導入しやすさを整理します。

あわせて、用途別のおすすめ、失敗しない選び方も解説します。 

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決済代行会社とは？

決済代行会社とは、事業者に代わってクレジットカード決済や各種オンライン決済の処理を一括で担う会社のことです。

本来、クレジットカード・PayPayなど複数の決済手段を導入するには、それぞれの決済ブランドと個別に契約やシステム連携を行う必要がありますが、決済代行会社と契約すれば、一度の契約で複数の決済方法をまとめて導入できます。

決済代行会社は、多様な決済手段の導入・セキュリティ対応まで提供するため、事業者は自社で複雑な決済システムを構築する必要がありません。

ECサイトやオンラインサービス、サブスク・月額課金、予約販売など、幅広いビジネスで利用されている仕組みです。

注目の決済サービス

サブスクペイ	月額パンダ
サブスク特化決済代行 継続課金×顧客管理 会員制サービスにおすすめ	個人使用・決済数1件も〇 年会費にも対応 最短1週間導入可
初期：問合せ 月額：問合せ	初期：0円 月額：0円
手数料：2.5%~	手数料：3.5％＋100円/1件
対応決済：クレカ、口座振替、コンビニ、スマホ決済など	対応決済：クレカ、口座振替など
サブスクペイの詳細	月額パンダの詳細

決済代行サービスの種類｜自社に合うタイプで選ぶ

決済代行サービスにはさまざまな種類があり、用途によって選ぶべきサービスは大きく異なります。ここでは事業形態や支払いシーンごとに整理した2種類の決済代行サービスを紹介します。

1. ToC向け（EC・オンライン販売向け）
2. ToB向け（オンラインでの請求向け）

1. ToC向けオンライン決済代行サービス

オンラインで商品やサービスを販売し、支払いをWeb上で完結させたい事業者向けの決済代行サービスです。
ECサイトの決済だけでなく、会費や月謝、利用料の回収にも対応でき、定期支払いや自動引き落としを行うビジネスにも適しています。

2. ToB向け請求決済代行サービス

法人取引や請求書ベースの支払いに対応した決済代行サービスです。
銀行振込や口座振替などを通じて、請求・回収業務を効率化できます。取引先が多い企業や、継続的な請求管理が必要なビジネスに適しています。

決済代行サービスの料金体系と相場

決済代行サービスの料金は、主に以下の3つで構成されます。

料金項目	内容	相場
初期費用	導入時に発生する費用	無料～数十万円
月額費用	毎月発生する固定費	数千円～数万円
決済手数料	決済金額に応じて発生する手数料	決済金額の2～4％程度

その他にも、サービスによっては決済処理料、振込手数料、オプション利用料などが発生します。料金を確認する際は、これらを含めた総額で判断することが重要です。

おすすめ決済代行会社ランキング｜料金・手数料を一覧で比較

決済代行サービスは、オンライン販売、店舗での対面決済、BtoB取引で必要な機能や料金体系が異なります。ここでは用途別に分けて、初期費用・月額費用・決済手数料などを比較します。

【ToC向け】オンライン向け決済代行会社・サービス一覧｜料金・手数料・特徴を比較

ECサイトやサブスク、会費・月謝の集金など、オンラインでの支払いに対応する決済代行サービスを比較します。

サービス名	イメージ	特徴	初期費用	月額費用	決済手数料
サブスクペイ （ROBOT PAYMENT）		継続課金も簡単	資料で確認	資料で確認	決済：2.5%~ 口座振替：85円~
Square		最短即日入金	0円 ※無料 無料アカウント登録	0円 無料アカウント登録	決済手数料：3.6％ ※継続課金：3.75％、販売手数料：0円
月額パンダ		固定費0円、決済数1件でもOK	0円 ※無料	0円 ※無料	3.5%+100円/件
Paysys		開発不要	0円~	0円~	3.3%~
会費ペイ		会員管理から月謝回収まで	0円 ※無料	0円 ※無料	3.5%＋150円/件
STORES 請求書決済		簡単にオンライン決済	0円	0円	1.98%~3.24%
Stripe		開発が簡単	0円 ※無料	0円 ※無料	3.6%～

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目的別に詳しく比較する場合は、以下の記事も参考にしてください。

目的別に決済代行サービスを詳しく比較▼

• メールやSMSで決済URLを送りたい場合は、メールリンク決済サービスの比較
• サブスクの決済を導入する場合は、サブスク決済システムの比較
• 定期的な自動課金を導入する場合は、継続課金システムの比較
• 月謝をカード決済・口座振替で集金する場合は、月謝引き落としシステムの比較
• Webサイトなしで決済ページを作る場合は、決済フォームの比較
• 家賃を口座振替で回収する場合は、家賃回収に口座振替を導入する方法
• 塾・習い事の月謝を口座振替で集金する場合は、塾・習い事の月謝に口座振替を導入する方法
• ECサイトにカード決済を導入する場合は、ECサイトにクレジットカード決済を導入する方法

【ToB向け】決済代行会社・サービス一覧｜料金・手数料・特徴を比較

法人間取引の請求・回収に対応する決済代行サービスを、料金や請求業務の対応範囲などで比較します。

サービス名

イメージ

タイプ

初期費用

月額費用

決済手数料

請求書発行費用

与信限度額

与信審査時間

未入金保証 （売掛金）

定期請求 サブスク

早期入金

末締め以外 個別請求書

支払い 期限延長

個人事業主

RP掛け払い

掛け払い・保証型

0円~ ※無料

請求数で変動 資料で確認

~3.4% 口振：85円/件

0円~ ※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

〇

〇

〇

問合せ

オリコのB2B決済サービス （売掛金決済保証）

掛け払い・保証型

0円~

0円~14,800円

～2.50%

0円※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

問合せ

問合せ

問合せ

〇

請求まるなげロボ

請求代行・債権管理型

0円~ ※無料

請求数で変動 資料で確認

1.0％~ 口振の場合：85円/件

0円

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

〇

〇

問合せ

問合せ

GMO掛け払い

BtoB EC決済インフラ型

0円※無料

0~1.4万円

0.5~3.4%

150~180円

1,000万円

~1週間

〇

〇

〇

〇

〇

〇

NP掛け払い

掛け払い・保証型

0円※無料

お問合せ

1.2~3.6％

190円

300万

企業与信：3営業日 取引与信：~2時間

〇

〇

〇

問合せ

〇

〇

Paid（ペイド）

掛け払い・保証型

0円 ※無料

0円 ※無料

0.5~3.1%

125円

1,000万円

最短即時～3営業日程度

〇

〇

〇

〇

〇

〇

決済代行会社・サービスの選び方｜ランキングで比較

紹介してきたように、業界や手法によっても手数料や特色は異なります。ここでは自社に合った決済代行サービスを選ぶ方法をご紹介します。

導入したい決済方法に対応できるか

決済代行サービスは、顧客が実際に利用する決済方法に対応しているかを確認して選びます。主な決済方法と導入するケースは以下の通りです。

決済方法	特徴・導入するケース
クレジットカード決済	VisaやMastercardなどによる決済。ECサイトやWebサービスでは基本となるため、オンライン販売・店舗ともに優先して導入する
コンビニ決済	コンビニの店頭で代金を支払う方法。クレジットカードを利用しない顧客にも対応するECサイトなどで導入する
口座振替	顧客の銀行口座から代金を自動で引き落とす方法。サブスク、月謝、会費など継続的に料金を回収する場合に導入する
後払い決済	商品の購入後にコンビニや銀行などで代金を支払う方法。ECサイトで支払い方法の選択肢を増やす場合に導入する
QRコード・電子マネー決済	PayPayなどのQRコードや交通系ICなどで支払う方法。飲食店や小売店など、店舗のキャッシュレス決済を充実させる場合に導入する

決済方法ごとの料金や手数料・サービスの選び方の解説記事

決済方法ごとの料金・手数料・サービスの選び方の解説記事▼

• クレジットカード決済代行会社を比較！手数料・選び方を解説
• コンビニ収納代行サービスを比較！手数料や支払い方法、選び方を解説
• 口座振替サービス比較！手数料やWeb対応を解説
• 後払い決済サービス比較！料金・手数料と選び方を解説

初期・月額費用と手数料の総額で比較する

決済代行サービスを選ぶ際は、初期費用や月額費用だけでなく、決済手数料を含めた総コストを確認することが重要です。

月額費用と手数料はサービス利用中ずっと発生し続ける「ランニングコスト」となるため、長期的にコストを抑えたい場合は特にしっかり確認することが大切です。
初期費用が無料でも、決済手数料が高いケースや、逆に月額費用がかかる代わりに手数料が低く抑えられているケースもあります。利用頻度や売上規模を想定したうえで、年間・月間のコストを比較しましょう。

こちらは人気のオンライン決済代行サービスの手数料ランキングです。

順位	イメージ	サービス名	決済手数料
🥇 1位		サブスクペイ	2.5%~
🥈 2位		月額パンダ	3.5%+100円/件
🥉 3位		会費ペイ	2.5%~+150円/件

入金サイクルは早いか

売上金がいつ入金されるか（入金サイクル）も、重要な比較ポイントです。
入金までに時間がかかると、資金繰りに影響が出る場合があります。日次・週次・月次などサービスによって入金タイミングは異なるため、自社の運営スタイルに合った入金サイクルかを確認しておくことが大切です。

順位	イメージ	サービス名	入金サイクル
🥇 1位		月額パンダ	クレカ：週次 口座振替：翌月10日
🥈 2位		サブスクペイ	月末締め翌月15日
🥈 2位		会費ペイ	月末締め翌月15日

サポート体制が充実しているか

決済代行サービスは、導入時だけでなく、運用中のトラブルにも対応できるサポート体制を確認して選びます。

確認する主なポイントは以下です。

• 電話・メール・チャットなどの問い合わせ方法
• サポートの受付時間
• 導入設定や開発時のサポート
• 決済エラーやシステム障害時の対応
• 専任担当者の有無

特にECサイトや店舗では、決済トラブルが売上に直結します。営業時間中に問い合わせできるか、緊急時に迅速な対応を受けられるかまで確認することが重要です。

セキュリティ対策が充実しているか

決済代行サービスは、クレジットカード情報や個人情報を安全に取り扱えるセキュリティ対策を確認して選びます。

公式サイトでは、以下のようなセキュリティ対策に対応しているか確認します。

• PCI DSS（カード情報を安全に扱うための国際的なセキュリティ基準）
• カード情報の非保持化（加盟店側でカード情報を保存しない仕組み）
• 不正検知（不審な決済を検知・防止する機能）
• 3Dセキュア（クレジットカード利用時の本人認証）
• 暗号化（通信やデータを第三者から読み取れない形にする仕組み）

決済情報の漏えいや不正利用は、金銭的な損失だけでなく企業の信用低下にもつながります。必要なセキュリティ基準を満たし、不正利用への対策が整っているサービスを選ぶことが重要です。

ここからは以下の種類別におすすめの決済代行サービス・会社を詳しく解説します。

本記事のランキングは、料金、対応決済、入金サイクル、導入負担、サポート、セキュリティ、機能性などを基準に、総合的に評価しています。ただし、決済代行会社は「総合順位」だけで選ぶと、自社に必要な決済方法や運用機能が不足する場合があります。

たとえば、ECサイトやSaaSではAPI連携やサブスク課金、3Dセキュアへの対応が重要です。一方で、スクール・会員制ビジネスでは口座振替や月謝集金、店舗販売も行う事業者では対面決済・請求書決済・オンライン決済をまとめて使えるかが選定ポイントになります。

• オンライン向け決済代行サービス・会社
• BtoB向け決済代行サービス・会社

おすすめ決済代行サービス・会社をランキングで比較｜ToC向け

BtoC向けのオンラインで決済代行を利用できるサービスを紹介します。

【ToC向け】用途別おすすめ決済代行サービス

ECサイトやSNS販売で利用できるサービスから、サブスクサービスを構築できる決済代行サービス、教室やスクールでオンラインで月謝を徴収できる決済代行サービスなどを紹介します。

おすすめの用途	おすすめサービス
サブスク・会員制サービスの月額料金を継続課金	サブスクペイ
習い事・個人教室の月謝や年会費を自動集金	月額パンダ
ECサイト・ネット販売でクレカ・コンビニ・PayPay決済を導入	Paysys
スクール・ジムの入会受付から会費集金まで一元管理	会費ペイ
メールで決済URLを送り、商品代金や月額料金を回収	サブスクペイ メールリンク決済
Instagram・LINEなどSNS経由で商品を販売	Square リンク決済
申込・予約フォームで決済を受け付け、顧客情報も管理	formrun メールリンク決済
Webサイト不要で請求書の決済URLを送り、代金を回収	STORES 請求書決済

おすすめランキング順に紹介します。

おすすめ決済代行サービス・会社をランキングで比較｜ToB向け

【ToB向け】用途別おすすめ決済代行サービス

おすすめの用途	おすすめサービス
企業間の掛け払いを導入し、与信審査から代金回収まで委託	RP掛け払い
請求書発行・集金・入金確認・督促をまとめて外部委託	請求まるなげロボ
毎月の請求書発行・入金消込・督促業務を自動化	請求管理ロボ

BtoB向けの決済代行会社・サービスをおすすめランキング順に紹介します。

決済代行サービスの導入の流れ

決済代行サービスは、申込み、審査、システム設定、テストを経て利用開始となるのが一般的です。

手順	内容
1. サービスを選ぶ	対応する決済方法、料金、入金サイクル、サポート体制などを確認してサービスを選ぶ
2. 決済代行会社に申し込む	事業者情報、販売する商品・サービス、Webサイトなどの必要情報を提出する
3. 審査を受ける	決済代行会社やカード会社などによる加盟店審査を受ける
4. システムを設定する	APIや決済画面の設定、店舗では決済端末の設定などを行う
5. テスト後に利用を開始する	決済が正常に処理されるか確認し、本番環境で決済受付を開始する

申込みから利用開始までは、一般的に1〜2か月程度が目安です。導入予定日が決まっている場合は、余裕をもって申し込みます。

まとめ｜用途を分けて決済代行会社を比較する

決済代行会社は、オンライン、店舗、BtoBで比較すべき項目が異なります。まず自社の販売チャネルと必要な決済手段を決め、次に初期・月額費用、決済手数料、入金条件、契約条件、セキュリティ・運用機能を比較してください。

料金が公開されていないサービスは、推測値や過去の料率を使わず、同じ取扱高・決済手段・入金条件で見積もりを取り、総コストで比較するのが適切です。

クレジットカード決済代行だけを詳しく比較したい場合は、下記の専門記事にてご確認ください。