請求管理システム&ソフト比較34選！無料おすすめ入金管理クラウドツールメリット・選び方・脱エクセル

請求管理システムとは｜業務範囲/機能/自動処理で経理業務を効率化

請求管理システムとはweb上で請求書や見積書など帳票作成から代金回収・入金消込・督促といった一連の経理業務を効率化し、会計ソフトと連動することで月次の売上管理・未入金管理が可能なシステムを指します。

紙やエクセル管理では請求業務の確認作業が多く会計ソフトへの転記など、人的ミスの発生や未払い企業の確認漏れも発生しやい状態でした。

しかしシステム活用することでオンライン上で請求作成から入金消込といった業務を1つのシステムで確認が可能です。

今回は請求管理システムの機能・規模や業界別の請求管理ソフトの種類を区分しながら、導入メリット・選び方や注意点をまとめ、後半ではおすすめの管理システムを紹介していきます。

請求業務の5つのプロセス・流れを図解 – 確認/入力が多くカバー範囲の広い経理業務

ツール選定・メリットの前にまずは請求管理業務のプロセスを図解しながら、経理業務をみていきます。

1. 作成側：請求書/見積書の作成・社内承認
2. 作成側：請求確定・PDFでのメール発行
3. 受取側：請求書の受領・内容確認
4. 受取側：経理担当者が振込・入金作業
5. 作成側：入金確認・消込・会計ソフト/POSレジ/基幹システム連携

まずは発注情報などを整理した上で請求書の作成を行いその後、社内承認を経て請求書を発行しメールや郵送などで送付します。

請求書を受け取った企業側も請求書内容を確認し社内チェックを経て、社内チェック・振込・入金を行います。

入金後は請求書作成側で入出金履歴の確認を行い未入金リストを作成し、消込作業や会計ソフト・POSレジと連携をします。このように請求管理には作成側・受取側で社内承認等様々な作業が発生します。

請求管理システムの機能 – 請求作成/明細自動取得/消込/催促/決算書を自動化

• 請求書/見積書/納品書/領収書など無料テンプレートから帳票作成
• 金融機関/クレジットカード明細の自動取得
• 取引データを元に自動で会計帳簿/決算書の自動作成
• 請求発行～入金管理・未払い督促など請求フロー全体の管理
• 会計ソフト・POSレジ・CRMなど外部システムとの連携

請求書管理システムでは請求書だけでなく見積書・納品書などをテンプレートから作成したり、帳票の作成が可能です。また発行後の請求書の送付から入金管理・未入金催促など請求フロー全体を管理することが出来ます。

また手間の多い消込業務も明細データを自動取得・売掛金と照合、総勘定元帳/仕訳帳など会計帳簿&決算書も自動作成が可能です。

加えてエクセル管理の場合は会計ソフトへの転記を行う二重入力が発生していましたが、システム連携を行うことでリアルタイムに売上データや未払い企業のリスト化ができ、様々な業務の効率化につながります。

請求業務効率化4つの方法｜規模別サービスの種類/特徴/主要システム比較

請求管理システム・代行サービスは大きく4つの領域に区分することができ、それぞれに業務範囲や対応している機能が異なります。 まずはそれぞれの特徴や機能を見ていきます。

企業規模	システム/サービス	機能/特徴	主要システム
個人事業主 小規模法人	クラウド会計ソフト Web請求発行システム	見積/納品/請求書の作成からメール送付 入金管理・会計ソフト連携で請求業務の効率化	ROBOT PAYMENT/Squareリンク決済 STORES請求書決済 GMOイプシロン/Misoca MF請求書/freee請求書
中小企業	請求管理システム 支払管理ソフト	帳票作成・送付に加えて入金消込/外部システム連携 未払い企業への督促メール/郵送代行も可能	GMO掛け払い/RP掛け払い 請求管理ロボ/楽楽明細/board MakeLeaps /イーメイサイプロ Aladdin Office/商奉行クラウド
中小~大規模	掛け払い決済 請求代行サービス	取引顧客が多く請求発行枚数が多い中小向け 与信審査から代金回収/消込/督促まで代行 未払いリスク保障/枠型取引も可能	GMO掛け払い/RP掛け払い 請求まるなげロボ ROBOT PAYMENT/NP掛け払い マネーフォワード ケッサイ 掛払い.com/Bizクレカ
大手企業	入金消込システム 債権管理ソフト	入金消込/請求管理だけでなく社内DB 基幹システム（ERP/販売管理/在庫管理）とAPI連携 消込/未払金/債権管理/返済予定管理	請求管理ロボ/Bill One/V-ONEクラウド 債権奉行クラウド/MFクラウド債権請求

例えば個人事業主の場合は無料から使えるクラウド型会計ソフトを利用すれば、請求発行システムと連携することで入金管理/消込/売上集計も一元管理ができます。

請求管理システムはBtoB企業の与信審査～催促メール/未払い企業リストを一覧化し、企業間取引の一連の業務をカバーでいています。

また中小～大規模向けの場合は請求件数・取引顧客も多いためシステム導入だけでなくアウトソースをする方法もあります。

掛け払い決済・請求代行サービスは上記の経理業務に関する一連のフローをアウトソースし、督促代行・未払い保障も行っています。

消込システム・債権管理ソフトは上場/大手企業など内部統制としても必要な要件を満たすためのツールで、多くの顧客を抱える場合は催促に応じず債権となった金額・支払いスケジュール管理が可能です。

（1）個人事業主/小規模法人 – 無料でクラウド会計&請求書作成ソフト

個人事業主や小規模法人におすすめなのがクラウド会計ソフト・web請求書作成/発行システムです。クラウド会計ソフトなどは会計帳簿・決算書作成も自動化ができます。

また請求書作成・発行ソフトでは請求作成から入金管理や消込処理も可能で、会計ソフトとの連携ができるため請求管理から売上まで一元管理ができます。

（2）中小企業 – 請求管理システム/与信審査/請求作成～入金消込まで業務全体カバー

中小企業向けには請求管理システムがおすすめです。請求書、見積書、納品書などの帳票作成から入金、未入金催促などの業務全体のカバーをすることが可能です。

また金融機関・クレジットカードからの明細データを自動取得し、取引情報から各種会計帳簿/決算書作成も自動化ができ、未払い企業への督促メールも自動送付で効率化が期待できます。

請求管理ロボではRPAツールと連携することで、これまでカバーできなかった複雑な料金体系の従量課金計算・継続課金処理・会計ソフト入力も自動化ができサブスク型のサービス企業におすすめです。

（3）中小~大規模 – 掛け払い&請求代行サービス/未入金督促/多様な決済方法一括導入

中小~大手企業におすすめなのは上記の請求管理システムに加えて、与信審査から消込/督促代行/未入金リスク保障も行う掛け払い決済・請求代行サービスです。

取引顧客が増えれば請求発行枚数も膨大になり社内の経理だけでは、与信審査までのタイムラグ・確認漏れなども発生する可能性がありますが経理業務をアウトソースすることで、社内のコア業務に集中ができます。

（4）大企業向け – 支払い遅延/滞納企業の支払予定管理/債権管理&入金消込システム

• 支払い滞納・滞留債権の回収予定日の管理
• 入金管理・消込作業の自動化
• 催告書送付・債務企業との交渉・督促訴訟手続きの代行

債権管理システムは入金管理や消込作業の自動化を行ったり、支払い滞納債権の回収予定日の管理などを行います。

また支払い遅延や滞納が起きた場合には催告書送付や催促訴訟手続の代行も可能です。

クラウド請求管理システム&ソフト導入が重要な理由・請求課題に関する効率化5つのメリット

BtoB・企業間取引における決済業務には様々な課題があります。ネットプロテクションズが実施した「決済業務に関する実態調査」のデータを参考に経理業務の課題とシステム導入のメリットを解説しています。

企業間決済の課題｜約90%が現金/請求書払い/ベンチャー経営者の75%が経理対応

1つ目の課題はBtoB領域でキャッシュレス化が進んでいない点です。ネットプロテクションズの調査では、企業間決済の方法は89％が現金・請求書払いというデータがあります。

また同じく89％近くが請求書払いを採用しており、多くの法人企業で支払い方法は現金や請求書による決済が一般的であるといえます。

企業の経営者であっても決済・支払い業務の経験があると回答した企業は全体で63.4%、ベンチャー企業では更に割合が高く75.5％の人が与信審査や入金管理・催促などの経理業務を経験しています。

具体的に大変だった業務に関する質問では「信用取引で入金されず未回収のまま逃げられた・入金確認が取れず、催促電話に一日費やした」など精神的にも大きなストレスが発生していることがわかります。

100社の壁 – 80%以上の経営者が重視するBtoB/企業間取引の”請求業務の効率化”

また同調査で決済業務効率化の重要性を聞いたところ、80％近くが重要と考えていると答えています。

具体的に効率化を意識し始めたタイミングについては「10社以上が52%、50社以上が25%、100社以上が13.6%」と100社を超える時期には90%以上の企業が効率化の意識が重要と考えています。

企業経営では50社・100社の壁といったことが言われますが、人事・組織課題だけでなく決済業務においても100社の壁が存在しているといえます。

（1）ペーパレス化で印刷/郵送コストの削減&クラウド上で紙保管のスペースが不要

1つ目のメリットはペーパーレス化が進むということです。請求管理システムを活用することで、各種帳票類の作成・印刷や捺印・発送といった押印・承認フローもツール上ですべて管理が可能です。

印刷代や郵送料なども省けるため大きなコスト削減にもつながり、請求書は個人事業主は5年、法人は7年保管する必要がありますがクラウド上でデータが保管されるためファイリングのスペースも不要です。

（2）クラウド型で専用端末不要・請求作成・発行業務の効率化につながる 

2点目はクラウド型のため、専用端末がなくてもインターネットが接続できればどこでも利用できるということです。

サービスによってはパソコンだけでなくスマホからもアクセスできるため場所も時間も気にする必要がなく、常に外で業務を行う業界には嬉しいポイントです。

また個人でレッスンスクールやサロン業界ではLINE連携やスマホで予約ページ作成が可能なサービスも登場しているため、PCは設置せずスマホで予約受付・コミュニケーションを取っていることも多いことでしょう。

スマホアプリを提供している企業も多いためPCがなくても簡単に請求作成・入金状況も確認できます。

（3）請求書のクラウド・電子管理によるカバナンス/セキュリティ強化 

3つ目は紙の請求書を電子化することで紛失といった人的ミスを削減し、管理がしやすくなる点です。また一部の請求書発行サービスではデータセンター内で強固なセキュリティを確保しています。

クラウド環境に懸念を抱き自社サーバー型（オンプレミス）を検討する企業も多いですが、認証方式・セキュリティ性の高いシステムであれば、情報漏洩などのリスク防止となります。

（4）請求ミス/入金管理漏れなどヒューマンエラー・エクセル管理の属人化防止

4つ目は請求ミスや管理漏洩などの人的ミス削減につながるということです。請求書作成サービスを活用することで作業を自動化することができるため、請求ミスや入金管理漏れなどの人的ミスを防ぐことが可能です。

サービスを導入することですべてのミスが防げるわけではありませんが、システム活用をすることで作成漏れ・発送忘れやといった自体は管理画面で一覧表示できるため避けることができます。

またエクセル管理で請求作成・消込の場合は高度な関数を用いるため難易度が高く、専門性も高くなりがちです。そのため作業者に技術と経験が求められるため属人的になる傾向があります。

経理担当者が退社・異動をしてしまうと消込ミスによるトラブルや未入金企業を放置される状態となる可能性がありますが、システム導入で誰でもリアルタイムに状況確認ができます。

請求業務のエクセル管理による課題・デメリットはこちらの記事で解説しています。

（5）会計ソフト/基幹システム連携で月次決算の早期化/リアルタイムに経営状況把握

加えて会計ソフト・基幹システムとの連携が一般的なため各種ソフトと連携することでエクセルからの二重入力・転記作業は不要で、売上管理・月次決算まで自動化できるため締め作業のスピードアップも期待できます。

エクセルでは可視化しづらい状況もシステム導入で、リアルタイムに経営データを確認し未払い企業の可視化で売掛金・未回収債権の早期発見ができキャッシュフローの安定につながります。

請求管理システム&ソフトの選び方・規模&目的別の検討ポイントと注意点

請求管理システム・ソフトの選び方や導入するときの注意点をご紹介します。

（1）業界・規模に適したシステムと機能｜効率化したい業務範囲の整理

紹介してきたように業界や規模によって提供されている請求管理システムにはさまざまな種類があります。まずは自社の業界にあったツールを検討しましょう。

また企業規模が大きくなれば商品数・営業人数・管理部門も増えるため請求フローに関わる人間が、どうしても多くなってしまいます。

部門が増えれば管轄範囲も明確に区分けされるようになるため、50～100名など一定規模の企業ではツール導入による効率化の範囲を要件定義し、導入検討に入ることがおすすめです。

ITレビュー・比較サイトなどでは比較表も設置されているため、参考にするのも良いでしょう。

（2）業務カバー範囲・機能の確認｜請求書発行/入金管理/督促/債権管理

また導入検討システムの業務のカバー範囲も併せて確認しましょう。Web請求書発行システムは規模・用途により機能や効率化できる範囲が大きく異なります。

請求書の作成だけができるものから入金管理・督促・債権管理までが可能なまでのものがあります。自社が利用したい範囲にあわせてその機能が備わっているのか否かを確認しましょう。

（3）システム連携｜販売管理・会計ソフト・基幹システムなどのデータ連携の確認

3点目は外部システムとの連携が可能かです。請求管理システムでは販売管理ソフト・会計ソフトなど外部システムと連携できなければ、効率化にはつながりません。

最低限の機能だけを導入して連携できないと結局余計な手間につながってしまう場合もあります。

そのようなことを避けるためにも、一定の顧客を抱えている・売上がある場合は自社で利用しているシステムと連携できるのか、どのようなシステムと連携できるのかも検討要件に入れましょう。

（4）セキュリティ/認証方式｜クラウド型システムは利用基盤&Pマーク/PCIDSS/ISMS取得

クラウド型システムの場合、どこからでもアクセスできるためPCの紛失・情報漏洩やハッキングのリスクがあります。

そのためアクセスするときにどのような認証方式でアクセスできるのか/権限設定/IP制限などのセキュリティ機能や、個人情報の取扱い/データ管理に関する認証取得についても確認しておきましょう。

また大規模なシステム導入・乗り換えの場合はサーバー環境などのシステム基盤も確認しておく必要があります。一般的にはBCP対策の領域に入るため情報システム部門とも連携しながら検討を進めましょう。

請求書作成&発行システム比較13選

ソフト/システム	イメージ	初期費用	月額費用	無料トライアル	決済/支払い	継続課金	郵送代行
ROBOT PAYMENT ※BtoBサブスク 消込/請求代行		お問合せ	お問合せ	なし	○ 2.65%~	◯	◯
Square請求書		0円 ※無料	フリー：0円 ※無料 プラス：3,000円	フリー：完全無料 あり 30日間	◯	◯	✕
STORES請求書決済		0円 ※無料	0円 ※無料	完全無料	◯	✕	✕
freee請求書		0円 ※無料	ミニマム：1,980円 ベーシック：3,980円 プロ：39,800円	あり 30日間	✕	✕	◯
Misoca		0円 ※無料	フリー：0円 ※無料 プラン15：800円 ※1年無料 プラン100：3,000円 ※1年無料 プラン1000：10,000円 ※1年無料 上記は作成枚数/月	あり 最大60日間	◯	✕	◯
MFクラウド請求書		0円 ※無料	ミニ：800円 パーソナル：980円 プラス：2,980円	あり 30日間	◯	✕	◯

請求業務一元管理システム4選

サービス名

イメージ

初期費用

月額費用

こんな人におすすめ

無料トライアル

請求書作成

発行代行

入金消込

入金確認

請求受領

未入金管理・督促

売上管理・分析

会計ソフト連携

その他データ連携

法対応

請求管理ロボ

問合せ

問合せ

求業務を効率化したい企業

問合せ

◯

◯

◯

◯

✕

◯

◯

弥生・勘定奉行・MFクラウドなど

Salesforce・kintone・SFA等

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

BillOne請求書受領

問い合わせ

問い合わせ

・紙ベースのアナログな業務で工数がかかる ・データを手作業で入力するためミスが起きやすい ・支払い業務に関するミスが発生してしまう ・法制度への対応で業務負荷が増加した

✕

〇

〇

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✕

〇

✕

✕

勘定奉行クラウド 勘定奉行11 弥生会計 freee会計

勘定奉行クラウド 勘定奉行11 弥生会計 やよいの青色申告

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

BtoBプラットフォーム請求書

問合せ

問合せ

請求書の電子化を進めたい企業

問合せ

〇

〇

✕

✕

〇

✕

✕

弥生・勘定奉行・PCA会計など

販売管理・ERP・受発注システム等

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

マネーフォワード クラウド請求書

無料

2,980円～

クラウドで請求書管理を行いたい企業

◯

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◯

◯

◯

✕

◯

◯

マネーフォワードクラウド会計

マネーフォワードクラウド一式

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

freee請求書

無料

1,980円～

シンプルな請求書管理を求める企業

◯

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✕

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◯

freee会計

freeeシリーズ間連携

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

MakeLeaps

無料

800円〜

コストを抑えて請求書管理をしたい企業

◯

◯

◯

◯

◯

✕

◯

◯

弥生・freee・勘定奉行など

Salesforce・kintone等

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

楽楽明細

100,000円〜

25,000円〜

大量の請求書を電子化したい企業

問合せ

◯

◯

✕

✕

✕

✕

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勘定奉行・弥生・PCAなど

販売管理・基幹システム等

インボイス制度対応 電子帳簿保存法

請求管理・請求代行サービス比較6選

サービス名	イメージ	初期費用	月額費用	決済手数料	請求書発行費用	与信限度額	審査時間	個人事業主	連携カート
RP掛け払い		0円~ ※無料	0円~ ※無料	~3.4%	0円~ ※無料	問い合わせ	問い合わせ	問い合わせ	CAM MACS Salesforce
Paid（ペイド）		0円 ※無料	0円 ※無料	0.5~3.1%	125円	1,000万円	最短即時～3営業日程度	〇	Bカート/makeshop  ECBB/ebisumart   EC-CUBE/One’s Closet/EverCart
請求まるなげロボ		お問合せ	お問合せ ※請求数で変動	1.0％~	0円	問い合わせ	問い合わせ	〇	CAM MACS Salesforce
BtoBクレカオールライトプラン		0円※無料	0円※無料	～2.24%	―	カード会社による	約14営業日	〇	✕ ※ECカート接続実績も有り、 個別相談にて対応可能
GMO掛け払い		0円※無料	0~1.4万円	0.5~3.4%	150~180円	1,000万円	~1週間	〇	ebisumart
NP掛け払い		0円※無料	お問合せ	1.2~3.6％	190円	300万	企業与信：3営業日 取引与信：~2時間	〇	Bcart/makeshop BtoB ebisumart/楽楽B2B
掛払い.com		0円※無料	お問合せ	1.2~3.6%	190円	上限なし	企業与信：当日 取引与信：即時~2時間	〇	楽楽B2B
マネーフォワード ケッサイ		0円※無料	お問合せ	0.5~3.6％	190円	1,000万	企業与信：2営業日 取引与信：即時	〇	Bcart/ebisumart
クロネコ掛け払い		0円※無料	お問合せ	2％~5％	0円	60万円	~1営業日	〇	Bcart/ebisumart
インフォマートの掛売決済		0円※無料	0円～	0.5～3.5%	問合せ	1,000万円	最短数秒～2営業日以内	〇	✕

債務管理・入金消込システム比較8選

おすすめの会計ソフト3選

【番外編】経理フロー改善に役立つビジネスクレカおすすめ3選