入金消込システム比較18選！機能や導入メリット・選び方のポイントを解説

今回は入金消込に関する業務フローを図解し、エクセルや紙によるアナログ管理のデメリット・入金消込システムの機能や導入メリットを解説しながら、規模別におすすめクラウドツールを紹介していきます。

入金消込システムとは

入金消込システムとは、取引先からの入金データと請求データを自動または半自動で照合し、入金消込作業を効率化・正確化するためのシステムです。

従来、経理担当者が銀行明細と請求書を突き合わせて手作業で行っていた入金確認・消込業務をシステム化することで、作業時間の大幅な削減、人的ミスの防止、月次決算の早期化などを実現します。

特に取引件数が多い企業や、振込名義がバラバラになりやすいBtoB取引を行う企業にとって、入金消込システムは経理DXの中核となる存在です。

入金消込システムを導入するメリット

入金消込業務に時間がかかり、月末月初に経理担当者の負担が集中していませんか。入金消込システムを導入すれば、銀行明細と請求データの突き合わせを自動化でき、煩雑な消込作業を大幅に削減できます。

まず、入金消込作業の工数削減が最大のメリットです。手作業での確認や入力が不要になり、日々の業務だけでなく締め作業もスムーズになります。

次に、消込漏れや入力ミスの防止です。ルールに基づいた処理により属人化を防ぎ、安定した業務運用と内部統制の強化につながります。

さらに、未消込入金や差額を即座に把握できるため、督促や返金対応を迅速に行えます。結果として、経理業務の生産性向上とキャッシュフロー改善を同時に実現できます。

入金消込システムの機能｜できること

入金消込システムには、入金確認から消込、会計処理までを効率化するための機能が備わっています。主な機能は次のとおりです。

機能	内容
入金データ自動取得	銀行口座の入出金明細を自動で取り込み、複数口座の情報を一元管理できる
請求データ自動照合	請求金額・請求番号・取引先情報などをもとに入金と請求を自動で突合する
名義揺れ補正	振込名義の表記違いや略称をルール設定や学習機能で吸収する
分割・合算入金対応	一部入金や複数請求に対するまとめ入金などの例外ケースに対応できる
未消込・差額管理	消込できていない入金や過不足金を一覧で確認できる
システム連携	会計システムや販売管理システムへ消込結果を連携し、仕訳作成を自動化できる

これにより、毎月の請求・入金処理を効率化し、経理担当者の業務負担を軽減しながら、入金漏れや回収遅延のリスクを防止できます。

入金消込システムの選び方｜4つの比較ポイント

入金消込システムは機能差が分かりにくいため、自社の業務・既存システムにフィットするかを軸に比較することが重要です。以下では、導入時に確認すべきポイントを具体的に解説します。

1. 自社の入金業務のパターンに対応しているか

まずは、現在の入金業務をそのまま置き換えられるかを確認します。分割入金や合算入金が発生するか、振込名義の揺れがどの程度あるかなど、自社の実態に対して無理なく対応できるかがポイントです。運用でカバーする前提のシステムは、結果的に負担が残りやすくなります。

2. 照合精度と自動化レベル

「自動消込」といっても、金額一致のみなのか、請求番号や取引先名を組み合わせて照合できるのかで実用性は大きく変わります。また、ルール設定や学習機能によって照合精度が向上するかも確認しておくと、運用後の手戻りを防げます。

3. 自社の既存システムと連携できるか

消込結果を自社で利用している会計ソフトや販売管理システムに自動反映できるかは重要な比較ポイントです。具体的には、消込済データを仕訳として自動作成できるか、売掛金管理に反映できるかを確認します。CSV連携かAPI連携かによって、運用負荷も変わるため注意が必要です。

4. 導入・運用のしやすさと料金

最後に、経理担当者が無理なく使い続けられるかを確認します。操作画面の分かりやすさや初期設定のしやすさに加え、自社業務を理解したサポートが受けられるかも重要です。費用面では、初期費用だけでなく月額費用や運用工数を含めて比較することが欠かせません。

入金消込システムのタイプ

入金消込システムは、入金消込を中心に、どこまでの業務をカバーするかによってタイプが分かれます。請求・販売管理・回収までを含むかどうかはサービスごとに異なるため、対応範囲を正しく理解することが重要です。

請求から入金消込までを1つのシステムで管理するタイプ

請求書の作成・送付と、入金確認・消込・債権残高の管理を1つのシステム上でまとめて行えるタイプです。販売管理機能を含むかどうかはサービスによって異なり、すでに販売管理システムを利用している場合は、連携可否の確認が必要です。請求管理と入金消込を分断せずに運用したい企業に向いています。

サービス名	特徴
請求管理ロボ	請求書発行から入金消込、督促までを一元管理。請求管理と入金管理をまとめて効率化したい企業向け
Bill One債権管理	バーチャル口座を活用した入金自動消込に強み。債権管理まで含めて可視化できる

入金消込に特化したタイプ

請求書発行や販売管理は既存システムをそのまま利用し、入金消込業務のみを効率化するタイプです。銀行明細の自動取得やAI照合により、名義揺れや分割・合算入金といった複雑な消込にも対応できます。請求・販売管理の仕組みを変えずに、消込作業の負担だけを減らしたい企業に適しています。

サービス名	特徴
V-ONEクラウド	AI照合による高精度な入金消込に特化。名義揺れ・分割・合算入金に強い
バクラク債権管理	入金消込に加え、仕訳作成や督促管理まで効率化。消込後の業務も含めて改善したい企業向け

請求・回収業務を外部に任せる代行型

請求書発行、入金確認、消込、督促、回収までを外部サービスに委託できるタイプです。このタイプのサービスには、売掛金保証を提供し、未回収リスクまで抑えられるものもあります。経理担当者の作業を最小限に抑えたい企業や、回収業務そのものを減らしたい企業に向いています。

サービス名	特徴
請求まるなげロボ	請求業務から入金消込・督促までを代行。売掛保証付きで回収リスクも軽減
RP掛け払い	与信・請求・回収をまとめて代行。経理業務の人的負担を最小化
オリコの売掛金決済保証	売掛金保証を軸に回収リスクを低減。既存業務を大きく変えずに導入可能

【比較表】入金消込システムの手数料・費用の相場が分かる

入金消込システムの費用はサービスごとに大きく異なり、月額制・従量課金・年間契約などさまざまです。初期費用が不要なものから機能に応じて料金が変動するものまであるため、自社の請求件数や運用方法に合った料金体系を選ぶことが重要です。主要サービスの費用と基本機能を一覧で比較できるようまとめました。

サービス名	イメージ	初期費用	月額費用	無料トライアル	自動消込	銀行入金 データ連携	未入金リスト 作成	督促メール 送信
請求管理ロボ		問合せ	※料金表をダウンロード	問合せ	◯	◯	◯	◯
Bill One債権管理		問合せ	資料で料金を見る	✕	◯	◯	◯	◯
BtoBプラットフォーム請求書		問合せ	問合せ	問合せ	◯	◯	◯	◯
V-ONEクラウド		問合せ	問合せ	問合せ	✕	◯	◯	△ ※作成は可能
バクラク債権管理		問合せ	33,000円～ ※12か月分の年間契約のみ	問合せ	◯	◯	◯	◯ ※バクラク請求書発行 の契約が必要
マネーフォワード クラウド債権管理		問合せ	問合せ	問合せ	◯	◯	◯	◯
債権奉行iクラウド		0円～	6,500円～ ※50,000 明細まで	問合せ	◯	◯	◯	△ ※作成は可能
請求QUICK		0円	0円～（従量課金制） 33円/請求書発行1枚※1 330円/銀行データ読み取り30回※2 ※1：50枚以降 ※2：30回以降	✕	◯	◯	◯	◯
invox発行請求書		0円	9,800円～ 55円/請求書発行1枚 55円/入金消込1件 ※入金消込はベーシックプラン	問合せ	◯	◯ ※10金融機関まで追加なし	◯	◯

おすすめ入金消込システム比較10選｜請求から入金まで効率化

入金消込まで代行できる請求代行サービス比較8選

サービス名

イメージ

初期費用

月額費用

決済手数料

請求書発行費用

与信限度額

審査時間

未入金保証 （売掛金）

定期請求 サブスク

早期入金

末締め以外 個別請求書

支払い 期限延長

個人事業主

連携システム・カード

RP掛け払い

0円~ ※無料

0円~ ※無料

~3.4%

0円~ ※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

問合せ

〇

〇

問合せ

キャムマックス Salesforce

オリコのB2B決済サービス（売掛金決済保証）

0円~

0円~14,800円

～2.50%

0円※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

問合せ

問合せ

問合せ

〇

問合せ

請求まるなげロボ

お問合せ

請求数で変動 資料で確認する

1.0％~

0円

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

〇

〇

問合せ

〇

キャムマックス Salesforce

GMO掛け払い

0円※無料

0~1.4万円

0.5~3.4%

150~180円

1,000万円

~1週間

〇

〇

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ebisumart

NP掛け払い

0円※無料

お問合せ

1.2~3.6％

190円

300万

企業与信：3営業日 取引与信：~2時間

〇

〇

〇

問合せ

〇

〇

Bcart/makeshop BtoB ebisumart/楽楽B2B

掛払い.com

0円※無料

お問合せ

1.2~3.6%

190円

上限なし

企業与信：当日 取引与信：即時~2時間

〇

〇

問合せ

問合せ

〇

〇

楽楽B2B

クロネコ掛け払い

0円※無料

お問合せ

2％~5％

0円

60万円

~1営業日

〇

問合せ

〇

問合せ

問合せ

〇

Bcart/ebisumart

Paid（ペイド）

0円 ※無料

0円 ※無料

0.5~3.1%

125円

1,000万円

最短即時～3営業日程度

〇

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〇

〇

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〇

Bカート/makeshop  ECBB/ebisumart   EC-CUBE/One’s Closet/EverCart

入金消込システムを導入する2つのデメリット・注意点

1. 導入コストやランニング費用が発生する

入金消込システムは多くの場合、初期費用や月額利用料が必要です。さらに取引件数や利用機能によって従量課金が発生するケースもあります。小規模企業にとってはコスト負担が大きくなる可能性があるため、費用対効果を事前にシミュレーションすることが重要です。

2. システム連携や運用開始までに時間がかかる

銀行や会計ソフト、基幹システムとのデータ連携を構築するには一定の準備が必要です。特にAPI連携や独自システムを使っている場合は設定やテストに時間がかかることがあります。導入前に、自社のフローにスムーズに組み込めるかを確認しておかないと、運用開始が遅れるリスクがあります。

入金消込システムの導入の流れ

入金消込システムを導入する際は、事前の業務整理からテスト運用・定着化までを段階的に進めることが重要です。以下の表では、一般的な導入プロセスを簡潔にまとめています。

ステップ	内容
1. 現状把握・課題整理	現在の入金管理フローを可視化し、 手作業やミスが発生している箇所を特定
2. 導入目的・要件定義	自動化したい業務・必要機能・連携システムを洗い出す
3. システム比較・選定	複数の入金消込システムを機能・費用・サポート面で比較
4. データ連携・運用設計	銀行・会計・販売管理システムとのAPI／CSV連携を設定
5. テスト運用・本番稼働	テストデータで照合精度や自動消込設定を確認後、本稼働へ移行
6. 運用改善・定期見直し	稼働後にKPIを測定し、設定・運用を継続的に改善

入金管理を効率化・消込自動化3つのトレンド – クラウド/ノーコード/ AI技術活用

これまではパソコンにインストールし社内で業務を行うことが一般的でしたが、ここ数年でクラウドツールが普及しWeb環境とPCがあればいつでも作業が可能です。

またkintoneやAppSuiteなどノーコード・業務用アプリ作成ツールを活用して、企業毎に必要なアプリケーションを取得し業務効率化を行う手法も近年のトレンドです。

またAI・機械学習など先端技術の活用も消込システムに活用されえおり、複雑な処理・チェック作業が頻繁に発生する売掛金/取引名称の照合やルールベースの仕訳で自動化もされています。