電子請求書サービス比較28選！選び方や種類、導入メリットや注意点まで徹底解説

電子請求書サービスとは請求書の作成や発行、受領などを効率化・代行するサービスです。電子請求書サービスの主な機能やタイプ、導入するメリット・デメリットを解説し、おすすめサービスも紹介します。

電子請求書サービスとは？

電子請求書サービスとは、PCやタブレットを使ってWeb上で請求書を作成・送付したり、電子請求書を受領したりするサービスです。中には、紙の請求書の受領からデータ化までを代行するサービスもあります。

電子請求書サービスの主な機能

電子請求書サービスは請求書の発行・受領に関するさまざまな機能を搭載しています。

請求書の作成・発行に関する機能

機能	内容
請求書の作成	必要項目を埋めるだけでテンプレートや フォーマットに沿った請求書を作成できます
各種帳票の作成	発注書や見積書など、請求書以外の各種帳票も 作成できるサービスが多いです
テンプレート	各種帳票のテンプレートを作成・管理できます 取引先ごとにテンプレートを作成したり、印影をつけたりできるサービスも
送信・郵送代行	電子請求書を電子メールやシステム上で送信できます PDFでダウンロードできる、印刷して郵送代行してくれるサービスも
データ連携	会計ソフトやCRM／SFAなどと連携し 各種システムのデータを電子請求書サービスに反映させられます
入金管理	入金データを取り込み、入金消込を自動化できます

請求書の受領に関する機能

機能	内容
受領代行	紙・電子などさまざまな形式の請求書を代わりに受け取ってもらえます 受領代行した請求書を一定期間保管するサービスもあります
データ化	請求書をテキストデータ化してもらえます 紙やPDFなど、さまざまな形式の請求書のデータ化が可能です
OCR・AI OCR	OCRとは光学文字認識のことで、手書きや印刷の文字を読み取りテキストデータ化します この機能があれば、データ化の代行がなくとも請求書の電子化を効率化できるでしょう
データ連携	会計システムなどとデータ連携し自動反映できます
データの保管・管理	データ化した請求書を保管・管理できます 保管した請求書を検索したり、条件を指定して抽出したりもできます
ワークフロー	請求回りのワークフロー機能がついたサービスもあります 請求業務の効率化や内部統制の強化につながる機能です

電子請求書サービスの種類・タイプ

電子請求書サービスは、大きく分けて3タイプがあります。導入目的によって最適なタイプが異なり、請求書業務の効率化・法令対応・資金管理の最適化など、得られる効果も変わります。

1. 発行・管理型：請求書の作成・発行・送付をオンラインで行うタイプ。郵送代行や会計ソフト連携にも対応し、発行業務を効率化。
2. 受領・データ化型：取引先から届く紙やPDF請求書を自動でデータ化し、支払処理を効率化。電子帳簿保存法・インボイス制度対応。
3. 掛け払い・請求代行型：請求・回収・与信管理までを代行。売掛金保証によって未回収リスクを抑え、キャッシュフローを安定化。

タイプ	代表的なサービス例
① 請求書発行・管理型	請求管理ロボ 請求まるなげロボ Bill One 債権管理 freee請求書 Square請求書
② 請求書受領・データ化型	Bill One 請求書受領 TOKIUMインボイス invox受取請求書
③ 掛け払い・請求代行型	RP掛け払い オリコB2B決済サービス GMO掛け払い NP掛け払い

おすすめの電子請求書サービス16選比較｜請求書発行・管理型

サービス名	イメージ	初期費用	月額費用	無料トライアル	請求書作成	発送代行	入金確認	入金消込	未入金管理・督促	会計ソフト連携	法対応
請求管理ロボ		問合せ	20,000円～ ※請求件数で変動	問合せ	〇	〇	〇	〇	〇	kintone、Salesforce 弥生会計、PCA会計DX MFクラウド会計など	インボイス制度対応 電子帳簿保存法
Bill One債権管理		問合せ	問合せ	✕	〇	〇	〇	〇	〇	問合せ	インボイス制度対応 電子帳簿保存法
Square請求書		0円※無料	フリー：0円※無料 プラス：3,000円	フリー：完全無料 プラス：30日間	〇	✕	〇	✕	問合せ	MFクラウド会計	問合せ
請求まるなげロボ		問合せ	問合せ ※請求数で変動	問合せ	〇	〇	〇	〇	〇	キャムマックス Salesforce	インボイス制度対応 電子帳簿保存法
Misoca		0円	0円～	1年間無料	〇	〇	〇	✕	△ （督促なし）	弥生会計 MFクラウド会計 freee会計	インボイス対応 電子帳簿保存法
マネーフォワード クラウド請求書		0円	法人向け：2,980円 個人向け：900円～	法人向け：1か月無料 個人向け：取引先3件まで無料	〇	〇	〇	〇	〇	MFクラウド会計 freee会計	インボイス制度 電子帳簿保存法
楽楽明細		100,000円	25,000円～	あり	〇	〇	〇	〇	〇	問合せ	インボイス制度 電子帳簿保存法
INVOY		0円	0円～	あり	〇	△ 別途費用発生	✕	〇	✕	弥生会計 MFクラウド会計 freee会計	インボイス制度 電子帳簿保存法

おすすめの電子請求書サービス16選比較｜請求書受領型

サービス名

イメージ

タイプ

初期費用

月額費用

従量課金

対象企業規模

AI-OCR

会計システム連携

郵送受領代行

メール受領代行

Webダウンロード

自社が アップロード

取引先が アップロード

オペレーター確認

仕訳自動生成

仕訳データ出力

請求管理ロボ

取引先が入力

問合せ

資料で確認

問合せ

全規模

問合せ

勘定奉行、freee 弥生会計、MFクラウド会計

問合せ

問合せ

問合せ

〇

〇

問合せ

〇

CSVファイル

BillOne請求書受領

受領代行＋ 請求書電子化

問合せ

資料で確認

問合せ

全規模

〇

勘定奉行、SAP、freee 弥生会計、MFクラウド会計

〇

〇

〇

〇

〇

〇

〇

CSVファイル

TOKIUMインボイス

受領代行＋ 請求書電子化

問合せ

10,000円〜

問合せ

中小〜大企業

〇

勘定奉行、SAP、freee OBIC、弥生会計、MFクラウド会計

〇

〇

〇

ー

ー

〇

〇

CSVファイル FBデータ（全銀データ）出力

マネーフォワードクラウド債務支払

受領代行＋ 請求書電子化

0円

2,480円〜 ※年払い

支払依頼：300円（月11件以上）/件 オペレーター入力：20円/枚

小規模〜中小企業

〇

マネーフォワード会計他 API連携

ー

〇

〇

〇

〇

問合せ

〇

CSVファイル、API連携 FBデータ（全銀データ）出力

バクラク請求書受取

受領代行＋ 請求書電子化

問合せ

問合せ

問合せ

中小〜中堅企業

〇

勘定奉行、freee OBIC、弥生会計、MFクラウド会計

〇 ※オプション

〇

〇

〇

〇

問合せ

〇

CSVファイル、API連携 FBデータ（全銀データ）出力

invox受取請求書

受領代行＋ 請求書電子化

0円

980円〜

オペレータ確認なし：50円/件 オペレータ確認あり：100円/件（税抜）

小規模〜中小企業

〇

勘定奉行、SAP、freee OBIC、弥生会計、MFクラウド会計

〇 ※オプション

〇

〇

〇

ー

〇

〇

CSVファイル、API連携 FBデータ（全銀データ）出力

freee受取請求書

請求書電子化

問合せ

19,980円〜 ※年払い

※月額費用に600枚/年含む 追加枠600枚：18,000円/年 超過従量課金50円/枚

小規模〜中小企業

〇

freee会計 その他は問合せ

ー

〇

〇

〇

〇

問合せ

〇

問合せ

BtoBプラットフォーム請求書

取引先が入力

問合せ

問合せ

通数に応じたプラン

全規模

〇

OBIC、弥生会計、MFクラウド会計

〇 ※invoxと連携

ー

ー

〇

〇

問合せ

〇

問合せ

奉行Edge 受領請求書DXクラウド

請求書電子化

0円

13,000円〜 ※年払い

600枚/年：156,000円 1,200枚/年：312,000円 2,400枚/年：576,400円

中小〜中堅企業

〇

勘定奉行 その他は問合せ

ー

ー

ー

〇

ー

問合せ

〇

CSVファイル、API連携 FBデータ（全銀データ）出力

スマートOCR請求書

請求書電子化

問合せ

問合せ

問合せ

中小〜中堅企業

〇

会計・銀行システム連携

ー

ー

ー

〇

ー

問合せ

問合せ

CSVファイル

請求書受領サービス18選比較！ 機能や料金、選び方を解説

おすすめの電子請求書サービス16選比較｜請求代行型

サービス名

イメージ

初期費用

月額費用

決済手数料

請求書発行費用

与信限度額

審査時間

未入金保証 （売掛金）

定期請求 サブスク

早期入金

末締め以外 個別請求書

支払い 期限延長

個人事業主

連携カート

RP掛け払い

0円~ ※無料

0円~ ※無料

~3.4%

0円~ ※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

問合せ

〇

〇

問合せ

キャムマックス Salesforce

オリコのB2B決済サービス（売掛金決済保証）

0円~

0円~14,800円

～2.50%

0円※無料

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

問合せ

問合せ

問合せ

〇

問合せ

請求まるなげロボ

お問合せ

お問合せ ※請求数で変動

1.0％~

0円

問い合わせ

問い合わせ

〇

〇

〇

〇

問合せ

〇

キャムマックス Salesforce

GMO掛け払い

0円※無料

0~1.4万円

0.5~3.4%

150~180円

1,000万円

~1週間

〇

〇

〇

〇

〇

〇

ebisumart

NP掛け払い

0円※無料

お問合せ

1.2~3.6％

190円

300万

企業与信：3営業日 取引与信：~2時間

〇

〇

〇

問合せ

〇

〇

Bcart/makeshop BtoB ebisumart/楽楽B2B

掛払い.com

0円※無料

お問合せ

1.2~3.6%

190円

上限なし

企業与信：当日 取引与信：即時~2時間

〇

〇

問合せ

問合せ

〇

〇

楽楽B2B

クロネコ掛け払い

0円※無料

お問合せ

2％~5％

0円

60万円

~1営業日

〇

問合せ

〇

問合せ

問合せ

〇

Bcart/ebisumart

Paid（ペイド）

0円 ※無料

0円 ※無料

0.5~3.1%

125円

1,000万円

最短即時～3営業日程度

〇

〇

〇

〇

〇

〇

Bカート/makeshop  ECBB/ebisumart   EC-CUBE/One’s Closet/EverCart

【2025年】請求代行サービスおすすめ10選比較！選び方や機能を解説

電子請求書サービスの選び方｜5つの比較ポイント

電子請求書サービスは、発行・受領のどちらに強いか、機能・費用・連携範囲が異なります。自社の課題を整理し、次の手順で選定すると失敗しにくくなります。

1. 自社の課題を明確にする
2. 機能の過不足を確認する
3. 料金プランをチェックする
4. 連携できる会計システムを確認する
5. 電子帳簿保存法・インボイス制度対応を確認する

1. 自社の課題を明確にする

まず、発行業務と受領業務のどちらに課題があるかを整理しましょう。「請求業務のために出社が必要」「人手不足でミスが多い」など、現場の課題を具体化することが最初のステップです。

課題が明確になれば、発行・受領・両対応のいずれのタイプが必要かが見えてきます。

2. 機能の過不足がないサービスを選ぶ

必要な機能を明確化し、過剰な機能を避けることが重要です。多機能すぎると操作が複雑になり、料金も上がります。自社の業務フローに合った機能だけを選ぶのが最適です。

例として、AI-OCRや郵送代行、API連携などは企業規模や体制によって必要度が異なります。

3. 料金プランを詳しくチェックする

プランごとに請求書枚数・ユーザー数・機能制限が異なります。発行・受領件数が多い場合は、従量課金の条件も必ず確認しましょう。一見安価でも、上限を超えると追加料金が発生するケースがあります。

4. 連携できる会計システムを確認する

会計ソフトとの連携やCSV入出力対応は、効率化のカギです。自社で使用しているシステム（freee、弥生、勘定奉行など）と連携できるかを事前にチェックしましょう。連携が不十分だと、手入力作業が残り、電子化のメリットを十分に活かせません。

5. 電子帳簿保存法・インボイス制度への対応を確認する

電子帳簿保存法やインボイス制度は定期的に改正されます。対応が遅いサービスを選ぶと、将来的に運用負担が増すため、法改正対応が自動反映されるクラウド型サービスが安心です

電子請求書サービスを導入する5つのメリット

電子請求書サービスの導入は、業務効率化だけでなく、人的ミスの防止・法令対応・内部統制の強化にもつながります。バックオフィスのDXを推進するうえで、今や欠かせない仕組みです。

1. 請求書回りの業務効率化

請求書の作成・発行・受領・保管までを自動化でき、紙業務を大幅に削減できます。テンプレート入力で請求書を簡単作成し、オンライン送付や郵送代行にも対応。
また、受領側ではAI-OCRや代行サービスでデータ化から保管まで一元化できるため、経理担当者の作業負担を減らし、スピーディーな処理が可能になります。

2. 請求業務の人的ミス防止

電子化により、入力・転記・確認作業を最小化できます。フォーマットが統一され、チェック漏れや入力ミスの防止につながります。
さらにOCR・AI OCRの自動読取機能を活用すれば、請求書情報を自社で手入力する必要がなく、ヒューマンエラーを削減できます。

3. 電子帳簿保存法への対応

電子請求書サービスを導入すれば、電子帳簿保存法やインボイス制度への改正対応を自動で反映。法令変更時もベンダー側でアップデートされるため、自社で要件確認やシステム修正を行う手間を省けます。
法令遵守と工数削減を同時に実現できる点が大きな強みです。

4. セキュリティ・内部統制の強化

請求書を電子化することで、紙の紛失・盗難リスクを回避できます。多くのサービスは権限設定や承認ワークフロー機能を備え、不正利用や誤操作を防止。
管理権限を明確化できるため、内部統制や監査対応の強化にも効果的です。

5. 多様な働き方への対応

クラウド型サービスにより、場所や時間を問わず請求処理が可能。出社せずに請求書の受領・承認が行えるため、リモートワークを促進します。
請求書の受領を代行するサービスを活用すれば、紙対応も不要になり、柔軟な働き方と業務継続性の両立が実現します。

電子請求書サービス導入時の注意点・デメリット

電子請求書サービスは効率化の効果が大きい一方で、コスト・運用負荷・取引先対応などの注意点もあります。導入前にこれらを把握し、対策を検討しておくことが重要です。

1. 月額料金がかかり続ける

多くの電子請求書サービスは月額課金制であり、利用を続ける限り費用が発生します。システム提供型でもBPO型でも、買い切り型ではないため長期的なコストを見込む必要があります。

ただし、人件費削減や業務効率化によるリターンが上回るケースも多く、費用対効果を定量的に比較することが大切です。

2. 従業員が慣れるまで時間がかかる

新システム導入時は操作習熟や教育コストが発生します。慣れるまで一時的に業務効率が下がることもありますが、多くのサービスは直感的なUI設計やサポート体制を備えており、短期間で定着可能です。

導入初期はマニュアル整備やトレーニング期間を設け、社内での運用ルールを統一するとスムーズに移行できます。

3. 紙の請求書を希望する取引先もいる

一部の取引先では紙での請求書送付を継続したい要望があります。その場合、電子化と紙対応が混在し、処理が煩雑になる可能性があります。

しかし、印刷・郵送代行機能や受領代行サービスを利用すれば、紙請求書にも柔軟に対応できます。電子化の流れを妨げず、移行期でも運用を安定させられるでしょう。

電子請求書サービスを導入し、法改正への対応を進めよう

電子請求書サービスにより請求書の発行・受領などを効率化・アウトソースができます。インボイス制度や電子帳簿保存法に対応したものも多く、法改正への対応も容易になるでしょう。

まずは、自社が請求書の発行と受領のどちらに課題を抱えているのかを考えてみてください。両方を効率化したいという企業も多いでしょう。そのうえで機能や請求書の発行・受領数の過不足がなく、既存システムと連携できるサービスを選ぶのがおすすめです。

ただ、サービスの公式HPだけではどれが自社に合っているかわからないかもしれません。気になるサービスは資料請求や問い合わせ、可能であれば無料トライアルなどをしてみて、自社との相性を見極めましょう。

電子請求書サービスが導入される背景

電子請求書サービスを導入することで、請求書の電子化はもちろん、管理や取引先とのやり取りもスムーズになるでしょう。事実、取引顧客が100社を超える経営者の9割以上が決済業務の効率化を意識していることがわかります。

グラフはBtoB後払い・掛け払いサービス「NP掛け払い」のベンダー・株式会社ネットプロテクションズの調査を基に、決済効率化への意識についてまとめたものです。

これによると8割の経営者が「企業成長で決済業務の効率化が重要」と考えています。取引社数が増えるほど効率化を意識し始める経営者が増えていることもわかります。

効率化の手段にある「管理システムなど機能の改修」「アウトソース」などが、電子請求書サービスにあたるものでしょう。2番目に多い「業務フロー改善」に、電子請求書サービスを組み込んでいる企業も多いと思われます。

実際、電子請求書サービスを導入することで請求書を検索・抽出できるようになり、管理がしやすくなります。郵送や仕訳などにかかる負担も軽くなるでしょう。これらのメリットについては、次から解説していきます。